85 lines
No EOL
2.7 KiB
TeX
85 lines
No EOL
2.7 KiB
TeX
\appendix
|
|
\chapter{Anhang}
|
|
\section{Nuklein- und Aminosäuresequenzen}
|
|
\microtypesetup{protrusion=false}
|
|
|
|
\begin{texshade}{./misc/seq_ref_aln.fa}
|
|
\setsize{names}{scriptsize}
|
|
\setsize{residues}{scriptsize}
|
|
\setsize{features}{tiny}
|
|
|
|
\setsize{names}{scriptsize}
|
|
\setfamily{names}{sf}
|
|
|
|
\shadingcolors{grays}
|
|
\showruler{1}{top}
|
|
\hidenumbering
|
|
\hideconsensus
|
|
\feature{bottom}{2}{71..71}{restriction}{Nde I}
|
|
\feature{bottom}{2}{2712..2712}{restriction}{BamH I}
|
|
\showcaption{Sequenzalignment der \acs{PPDK}-kodierenden Sequenz im Vektor pETEV-16b-ppdk und der
|
|
Referenzsequenz}
|
|
\shortcaption{Sequenzalignment pETEV-16b-ppdk}
|
|
\end{texshade}
|
|
|
|
\clearpage
|
|
|
|
\begin{texshade}{./misc/ma_as_aln.fa}
|
|
\shadingmode{similar}
|
|
\threshold[80]{50}
|
|
|
|
\nameseq{1}{F. trinervia}
|
|
\nameseq{2}{F. brownii}
|
|
\nameseq{3}{Zea mays}
|
|
\nameseq{4}{C. symbiosum}
|
|
|
|
\setsize{names}{scriptsize}
|
|
\setfamily{names}{sf}
|
|
\setsize{residues}{scriptsize}
|
|
\setsize{numbers}{scriptsize}
|
|
\setsize{features}{tiny}
|
|
\setfamily{legend}{sf}
|
|
\setsize{legend}{scriptsize}
|
|
\setsize{featurestyles}{scriptsize}
|
|
\showruler{1}{top}
|
|
\hidenumbering
|
|
\defconsensus{{$\bullet$}}{{$\bullet$}}{{$\bullet$}}
|
|
\showconsensus[ColdHot]{bottom}
|
|
\nameconsensus{conservation}
|
|
% \showlegend
|
|
\showcaption{Multiples Alignment der Aminosäuresequenzen der \acs{PPDK}s aus \acs{F. trinervia}, \acs{F. brownii}, \textit{Zea mays} und
|
|
\acs{C. symbiosum}. Sequenzidentitäten sind farbkodiert dargestellt: \SI{100}{\percent} Identität (violett), \SI{75}{\percent} (blau) und
|
|
\SI{50}{\percent} (rosa).}
|
|
\shortcaption{Multiples Alignment der Primärstrukturen verschiedener PPDKs}
|
|
\label{abb:ma}
|
|
\end{texshade}
|
|
|
|
\microtypesetup{protrusion=true}
|
|
\clearpage
|
|
|
|
\section{Evalutation der Homologiemodelle}
|
|
\begin{figure}[htb]
|
|
\centering
|
|
\includegraphics[height=0.5\textheight,keepaspectratio=true]{./img/anhang/FtPPDK_Zm.eps}
|
|
% FtPPDK_Zm.eps: 0x0 pixel, 300dpi, 0.00x0.00 cm, bb=0 -1 474 638
|
|
\caption{Ramachandran-Plot des von \textit{Zea mays} abgeleiteten Homologiemodells}
|
|
\label{abb:ramachandran_Zm}
|
|
\end{figure}
|
|
\begin{figure}[htb]
|
|
\centering
|
|
\includegraphics[height=0.5\textheight,keepaspectratio=true]{./img/anhang/FtPPDK_Cs.eps}
|
|
% FtPPDK_Cs.svg: 765x990 pixel, 72dpi, 26.99x34.92 cm, bb=0 0 765 990
|
|
\caption{Ramachandran-Plot des von \acs{C. symbiosum} abgeleiteten Homologiemodells}
|
|
\label{abb:ramachandran_Cs}
|
|
\end{figure}
|
|
|
|
|
|
\chapter{Erklärung}
|
|
Hiermit versichere ich, dass ich die vorliegende Masterarbeit selbstständig verfasst und keine anderen, als die angegebenen Quellen und
|
|
Hilfsmittel benutzt habe. Alle Stellen, die ich aus den Quellen wörtlich oder inhaltlich entnommen habe, sind als solche kenntlich gemacht.
|
|
|
|
\vspace{6em}
|
|
|
|
\noindent \rule{7cm}{1pt}
|
|
|
|
Alexander Ralph Michael Minges \hfill Düsseldorf, \today |