Material/Methoden: CD-Spektroskopie
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5fe6bb4327
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\acro{A. thaliana}[\textit{A. thaliana}]{\textit{Arabidopsis thaliana}}
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\acro{A. thaliana}[\textit{A. thaliana}]{\textit{Arabidopsis thaliana}}
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\acro{BisTris}{Bis(2-hydroxyethyl)amino-tris(hydroxymethyl)methan}
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\acro{BisTris}{Bis(2-hydroxyethyl)amino-tris(hydroxymethyl)methan}
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\acro{BSA}{Bovines Serumalbumin}
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\acro{BSA}{Bovines Serumalbumin}
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\acro{CD}{Circularer Dichronismus}
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\acro{CD}{Circulardichronismus}
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\acro{cmc}{\textit{critical micelle concentration}, kritische Mizellenkonzentration}
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\acro{cmc}{\textit{critical micelle concentration}, kritische Mizellenkonzentration}
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\acro{CTR1}{\textit{CONSTITUTIVE TRIPLE RESPONSE 1}}
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\acro{CTR1}{\textit{CONSTITUTIVE TRIPLE RESPONSE 1}}
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\acro{CV}{\textit{column volume}, Säulenvolumen}
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\acro{CV}{\textit{column volume}, Säulenvolumen}
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@ -14,6 +14,7 @@
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Analysen-/Präzisionswaagen & Sartorius, Göttingen\\
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Analysen-/Präzisionswaagen & Sartorius, Göttingen\\
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Autoklav & H+P Labortechnik, Oberschleißheim\\
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Autoklav & H+P Labortechnik, Oberschleißheim\\
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Automatische Pipetten & Gilson, Bad Camberg\\
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Automatische Pipetten & Gilson, Bad Camberg\\
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\ac{CD}-Spektrometer J-715 & JASCO Corp., Gross-Umstadt\\
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DNA-Gelkammersystem PerfectBlue & PEQLAB Biotechnologie, Erlangen\\
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DNA-Gelkammersystem PerfectBlue & PEQLAB Biotechnologie, Erlangen\\
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Elektroblotter PerfectBlue 'Semi-Dry' & PEQLAB Biotechnologie, Erlangen\\
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Elektroblotter PerfectBlue 'Semi-Dry' & PEQLAB Biotechnologie, Erlangen\\
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Fluoreszenzspektrometer LS 55 & PerkinElmer, Rodgau\\
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Fluoreszenzspektrometer LS 55 & PerkinElmer, Rodgau\\
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@ -478,9 +479,19 @@ Wie beim photometrischen Bindungsnachweis erfolgte die Bestimmung der tatsächli
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60 & 9,5 &\\
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60 & 9,5 &\\
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\bottomrule
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\bottomrule
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\end{tabularx}
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\end{tabularx}
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\label{tab:haemin_konzentration_photometrie}
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\label{tab:haemin_konzentration_fluoreszenz}
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\end{table}
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\end{table}
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\clearpage
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\clearpage
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\subsubsection{\ac{CD}}
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\subsubsection{\acs{CD}-Spektroskopie}
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\label{sec:nachweis_haemin_bindung_cd}
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\label{sec:nachweis_haemin_bindung_cd}
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Bei der \ac{CD}-Spektroskopie wird die Wechselwirkung von optisch aktiven Substanzen mit zirkular polarisiertem Licht zu analytischen Zwecken ausgenutzt. Eine links- und eine rechtszirkulare Lichwelle überlagern sich hierbei zu linear polarisiertem Licht. Optisch aktive Substanzen weisen für die links- bzw. rechtszirkulare Komponente unterschiedliche Absorptionskoeffizienten \textepsilon$_\text{L}$ und \textepsilon$_\text{R}$, wobei letztlich ihre Differenz $\Delta\varepsilon$ gemessen und als Elliptizität $\theta$ engegeben. $d$ sei die Schichtdicke und $c$ die Konzentration $c$ angegeben \citep{lottspeich_bioanalytik_2006}:
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\begin{equation}
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\theta (\lambda) = \Delta\varepsilon \cdot c \cdot d
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\end{equation}
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Die \ac{CD}-Spektroskopie kann für die Analyse von Proteinsekundärstrukturen eingesetzt werden. Hierbei werden Spektren im Bereich von \SIrange{160}{250}{\nano\meter} aufgenommen. Man macht sich dabei zu Nutze, dass in diesem Bereich die $n \rightarrow \pi^*$ bzw. $\pi \rightarrow \pi^*$-Übergänge der Peptidbindung liegen. Durch ihre Chiralität reagiert das \ac{CD}-Spektrum eines Peptids sehr empfindlich auf Änderungen der Sekundärstruktur \citep{lottspeich_bioanalytik_2006}.
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Die Messungen erfolgten in CD-Puffer bei einer Proteinkonzentration von \SI{0,5}{\milli\gram\per\milli\liter}.
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