Umstellung auf LuaLaTeX

inc/material.tex

@@ -11,7 +11,7 @@
   Autoklav                                                 & Thermo Fisher Scientific, Bonn\\
   Automatische Pipetten                                    & Gilson, Bad Camberg\\
   \acs{CD}-Spektrometer J-715                              & JASCO Corp., Gross-Umstadt\\
-  Chromatographiesystem \newlineÄKTAprime plus             & GE Healthcare, Freiburg \\
+  Chromatographiesystem \newline ÄKTAprime plus             & GE Healthcare, Freiburg \\
   DNA-Gelkammersystem PerfectBlue                          & PEQLAB Biotechnologie, Erlangen\\
   Elektroblotter PerfectBlue 'Semi-Dry'                    & PEQLAB Biotechnologie, Erlangen\\
   Gelsysteme für große Gele                                & Zentralwerkstatt, Uni Düsseldorf\\
@@ -251,6 +251,7 @@ nach Herstellerangaben.
 
 \subsection{Restriktionsverdau von \acs{DNA}}
 \label{sec:restriktionsverdau_dna}
+\begin{samepage}
 Im Zuge der Klonierung wurde der Zielvektor pET-16b über die beiden Restriktionsenzyme \textit{BamH}I und \textit{Nde}I linearisiert.
 Der Verdau erfolgte in einem Ansatzvolumen von \SI{25}{\micro\liter} bei \SI{37}{\celsius} über einen Zeitraum von \SI{2}{\hour}.
 \begin{description}
@@ -261,6 +262,7 @@ Der Verdau erfolgte in einem Ansatzvolumen von \SI{25}{\micro\liter} bei \SI{37}
  \SI{10}{\Unit} \textit{Nde}I\\
  ad \SI{25}{\micro\liter} \ce{dH2O}
 \end{description}
+\end{samepage}
 
 
 \subsection{\acl{PCR}}
@@ -280,10 +282,11 @@ vervielfacht werden.
 
 \subsubsection{Herstellung von Inserts für die \acs{SLIC}}
 \label{sec:inserts_slic}
+\begin{samepage}
 Die Synthese von Inserts für eine \ac{SLIC} (vgl. \ref{sec:slic}) wurde mittels einer \ac{PCR} nach folgendem
 Ansatz durchgeführt:
 \begin{description}
- \item[\ac{PCR}-Ansatz (\SI{50}{\micro\liter})] \hfill \\
+ \item[\ac{PCR}-Ansatz] \hfill \\
   \SI{1}{\micro\liter} DNA (Templat) \\
   \SI{2}{\micro\liter} 3'-Primer (\SI{10}{\micro\Molar}) \\
   \SI{2}{\micro\liter} 5'-Primer (\SI{10}{\micro\Molar}) \\
@@ -292,11 +295,12 @@ Ansatz durchgeführt:
   \SI{0,5}{\micro\liter} dNTPs (\SI{10}{\milli\Molar}) \\
   ad \SI{50}{\micro\liter} dH2O
 \end{description}
+\end{samepage}
 Das verwendete Cyclerprogramm ist in Tabelle \ref{tab:slic_cycler} aufgeführt. Bei der Berechnung
 der Annealing-Temperatur wurde im Fall der ersten zehn Zyklen die Schmelztemperatur
-des zum \ac{PPDK}-Gen homologen Primerabschnitts zu Grunde gelegt. In den letzten
+des zum \acs{PPDK}-kodierenden Bereich homologen Primerabschnitts zu Grunde gelegt. In den letzten
 zwanzig Zyklen die Schmelztemperatur des zum Zielvektor homologen Primerbereichs.
-\begin{table}
+\begin{table}[hbt]
 \centering
 \caption[Cyclerprogramm \acs{SLIC}]{Cyclerprogramm für die Synthese von Inserts zur \acs{SLIC}}
 \begin{tabular}{ccc}
@@ -330,7 +334,7 @@ Zur Generierung der 5'-Überhänge wurden \SI{1000}{\nano\gram} Vektor- bzw. Ins
 
 \begin{description}
  \item[Ansatz für \ac{SLIC}-Dau (\SI{35}{\micro\liter})] \hfill \\
- x~\si{\micro\liter} \acs{DNA}~\textequiv~\SI{1000}{\nano\gram} \acs{DNA}\\
+ x~\si{\micro\liter} \acs{DNA}~≡~\SI{1000}{\nano\gram} \acs{DNA}\\
  \SI{2}{\micro\liter} \acs{BSA} (\SI{1}{\milli\gram\per\milli\liter})\\
  \SI{4}{\micro\liter} NEBuffer 2 (New England Biolabs, Frankfurt)\\
  \SI{1}{\Unit} T4-DNA-Polymerase (New England Biolabs, Frankfurt)\\
@@ -345,8 +349,8 @@ In das nachfolgende Annealing wurden \SI{150}{\nano\gram} Vektor-\acs{DNA}, sowi
 
 \begin{description}
  \item[\acs{SLIC}-Annealing (\SI{10}{\micro\liter})] \hfill \\
- x \si{\micro\liter} Vektor-\acs{DNA} \textequiv~\SI{150}{\nano\gram}\\
+ x \si{\micro\liter} Vektor-\acs{DNA} ≡~\SI{150}{\nano\gram}\\
- y \si{\micro\liter} Insert-\acs{DNA} \textequiv~\SI{141}{\nano\gram}\\
+ y \si{\micro\liter} Insert-\acs{DNA} ≡~\SI{141}{\nano\gram}\\
  \SI{1}{\micro\liter} T4-Ligase Puffer (New England Biolabs, Frankfurt)\\
  ad \SI{10}{\micro\liter} \ce{dH2O}
 \end{description}

masterarbeit.kilepr

@@ -4,7 +4,7 @@ img_extIsRegExp=false
 img_extensions=.eps .jpg .jpeg .png .pdf .ps .fig .gif
 kileprversion=2
 kileversion=2.1.2
-lastDocument=masterarbeit.tex
+lastDocument=inc/material.tex
 masterDocument=
 name=Masterarbeit
 pkg_extIsRegExp=false
@@ -123,8 +123,8 @@ encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
 line=9
 mode=LaTeX
-open=true
+open=false
-order=0
+order=1
 
 [item:inc/abstract.tex]
 archive=true
@@ -133,7 +133,7 @@ encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
 line=3
 mode=LaTeX
-open=true
+open=false
 order=2
 
 [item:inc/anhang.tex]
@@ -143,8 +143,8 @@ encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
 line=1
 mode=LaTeX
-open=true
+open=false
-order=7
+order=3
 
 [item:inc/diskussion.tex]
 archive=true
@@ -153,8 +153,8 @@ encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
 line=0
 mode=LaTeX
-open=true
+open=false
-order=6
+order=4
 
 [item:inc/einleitung.tex]
 archive=true
@@ -163,8 +163,8 @@ encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
 line=0
 mode=LaTeX
-open=true
+open=false
-order=3
+order=5
 
 [item:inc/ergebnisse.tex]
 archive=true
@@ -173,18 +173,18 @@ encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
 line=0
 mode=LaTeX
-open=true
+open=false
-order=5
+order=6
 
 [item:inc/material.tex]
 archive=true
-column=10
+column=62
 encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
-line=166
+line=229
 mode=LaTeX
 open=true
-order=4
+order=1
 
 [item:inc/zusammenfassung.tex]
 archive=true
@@ -193,7 +193,7 @@ encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
 line=1
 mode=LaTeX
-open=true
+open=false
 order=8
 
 [item:masterarbeit.kilepr]
@@ -208,13 +208,13 @@ order=-1
 
 [item:masterarbeit.tex]
 archive=true
-column=24
+column=31
 encoding=UTF-8
 highlight=LaTeX
-line=98
+line=15
 mode=LaTeX
 open=true
-order=1
+order=0
 
 [view-settings,view=0,item:inc/abkuerzungen.tex]
 CursorColumn=54
@@ -253,8 +253,8 @@ JumpList=
 ViMarks=
 
 [view-settings,view=0,item:inc/material.tex]
-CursorColumn=10
+CursorColumn=62
-CursorLine=166
+CursorLine=229
 JumpList=
 ViMarks=
 
@@ -265,7 +265,7 @@ JumpList=
 ViMarks=
 
 [view-settings,view=0,item:masterarbeit.tex]
-CursorColumn=24
+CursorColumn=31
-CursorLine=98
+CursorLine=15
 JumpList=
 ViMarks=

masterarbeit.tex

@@ -1,3 +1,4 @@
+% !Mode:: "TeX:UTF-8"
 \documentclass[final,                           % Bearbeitungsstatus: final/draft
                a4paper,                         % DIN A4
                fontsize=13pt,                   % Schriftgröße: 13 pt
@@ -9,8 +10,18 @@
                BCOR=1cm,                        % Berücksichtigung eines Binderands im Satzspiegel
                headsepline=true,                % Trennlinie zur Kopfzeile
                oneside,                         % Einsitiges Dokument
-               headinclude                      % Kopf dem Satzspiegel zurechnen wg. lebendem Kolumnentitel
+               headinclude,                     % Kopf dem Satzspiegel zurechnen wg. lebendem Kolumnentitel
+               ngerman,                         % Benutzte Sprachen werden global definiert (benötigt von
+               english                          %   siunitx)
                ]{scrreprt}                      % Dokumentenklasse
+
+\usepackage{fixltx2e}
+\usepackage{fontspec}
+\usepackage{libertineotf}
+\defaultfontfeatures{Ligatures=TeX} %,Numbers=OldStyle}% ,Scale=MatchLowercase} bug in current Biolinum
+
+%\usepackage{lua-visual-debug}
+
 \usepackage[automark,                           % Lebende Kolumnentitel
             autooneside,                        % Berücksichtigung der Einseitigkeit des Dokuments
             headsepline
@@ -24,15 +35,13 @@
 %\ohead{\pagemark}                               % Seitenkopf außen: Seitenzahl
 
 \pdfcompresslevel=9
-\usepackage[utf8]{inputenc}       % Eingabekodierung UTF-8
+\usepackage{babel}       % Neue Deutsche Rechtschreibung/Silbentrennung mit griechischen Buchstaben
-\usepackage[T1]{fontenc}          % Schriftkodierung
-\usepackage{libertine}            % Schriftarten 'Linux Libertine' und 'Linux Biolinum'
-\usepackage[ngerman,english]{babel}       % Neue Deutsche Rechtschreibung/Silbentrennung mit griechischen Buchstaben
 \usepackage{setspace}             % Paket für das Setzen des Zeilenabstandes
 \onehalfspacing                   % 1,5facher Zeilenabstand
 \usepackage[draft,kerning,spacing,protrusion=true,expansion,tracking=true,babel=true]{microtype} %Mikrotypographie (erweitertes Kerning, etc.)
 \usepackage{acronym}              % Abkürzungen und Abkürzungsverzeichnis
-\usepackage[alsoload=synchem,locale=DE,loctolang={DE:ngerman},obeyall=true,decimalsymbol={{{,}}},tophrase={{ bis }}]{siunitx}   % SI-Einheiten
+\usepackage[alsoload=synchem,locale=DE,obeyall,math-micro=\textmu,text-micro=\textmu]{siunitx}
+            
 \newunit{\bp}{bp}                 % Definition eigener Einheiten: Basenpaare
 \newunit{\kb}{kb}                 % Definition eigener Einheiten: Kilo-Basenpaare
 \newunit{\Unit}{U}                % Definition eigener Einheiten: Unit
@@ -51,7 +60,6 @@
 \usepackage{graphicx}                               % Grafikerweiterung
 \usepackage[version=3]{mhchem}                      % Darstellung chemischer Summenformeln
 \usepackage{natbib}                                 % Naturwissenschaftliche Zitierungsstile
-%\usepackage[format=hang]{caption}[2008/08/24]      % Formatierung von Bildunter-/Tabellenüberschriften
 \usepackage[format=plain,footnotesize]{caption}[2008/08/24]
 \usepackage{subcaption}                             % Untergeordnete Abbildungen
 \usepackage[fixlanguage]{babelbib}                  % Sprachanpassung für Literaturverzeichnis
@@ -76,17 +84,15 @@
     urlcolor=black           % color of external links
 }
 
-%Griechische Buchstaben/Symbole in Hauptschriftart für den Textmodus
+\usepackage{unicode-math}
-\renewcommand{\textalpha}{{\libertineGlyph{alpha}}}
+\setmathfont{Asana Math}
-\renewcommand{\textbeta}{{\libertineGlyph{beta}}}
+\setmathfont[range=\mathit/{latin,Latin,num,Greek,greek}]{Linux Libertine O Italic}
-\renewcommand{\textepsilon}{{\libertineGlyph{epsilon}}}
+\setmathfont[range=\mathup/{latin,Latin,num,Greek,greek}]{Linux Libertine O}
-\renewcommand{\texttheta}{{\libertineGlyph{theta}}}
+\setmathfont[range=\mathbfup/{latin,Latin,num,Greek,greek}]{Linux Libertine O Bold}
-\renewcommand{\textDelta}{{\libertineGlyph{Delta}}}
+\setmathfont[range=\mathbfit/{latin,Latin,num,Greek,greek}]{Linux Libertine O Bold Italic}
-\renewcommand{\textpi}{{\libertineGlyph{pi}}}
+\setmathfont[range={"221E}]{Linux Libertine O}% "0221E = \infty
-\renewcommand{\textlambda}{{\libertineGlyph{lambda}}}
+\setmathfont[range={"2261}]{Linux Libertine O}% "02261 = \eqiv
-\renewcommand{\textrightarrow}{{\libertineGlyph{arrowright}}}
+
-\renewcommand{\textregistered}{{\libertineGlyph{registered}}}
-\newcommand{\textequiv}{{\libertineGlyph{equivalence}}}
 
 %opening
 \titlehead{\centering \includegraphics[keepaspectratio=true,width=0.4\textwidth]{./img/HHU_Logo.eps}}